應用經濟學系始建于1993年，現擁有應用經濟一級學科博士點和能源與氣候經濟交叉學科博士點，共10個二級學科的碩士招生權。目前本系的研究方向有：農業與發展經濟、能源與氣候經濟、產業經濟學、國際貿易與金融等。本系由“國家杰出青年科學基金獲得者”胡瑞法教授領銜的14名專職教師組成（含外籍教師一名）。其中教授3人，副教授9人，講師2人; 教師全部擁有博士學位和海外經歷。目前博士生導師5人，全部14人均有碩士研究生的招生資格。目前本系有在讀博士研究生8名；應用經濟學專業、MBA、MPA、工程碩士等各類在讀研究生70余名；每年具有5-7名博士研究生和20-30名碩士研究生的招生名額。
目前本系教師承擔了宏觀經濟學、微觀經濟學、國際貿易、國際金融、國際服務貿易、管理學原理、產業經濟學、區域經濟學、能源經濟學、發展經濟學、國際投資學、管理系統工程、管理統計學、項目管理、應用經濟學前沿、高級微觀經濟學、發展經濟學前沿等本科生、碩士生和博士生的近30門課的教學任務。本系教師主編或參編出版了《能源經濟學》、《中國公共財政知識讀本》、《國際金融》、《宏觀經濟學》、《國際貿易理論與政策》、《創新管理》、《中國市場化進程》、《金融管理決策系統》、《后發優勢演化論：中國經濟可持續追趕研究》、《論中國對外貿易的可持續發展》等教材、著作20多部，其中大多數成為本校及全國高校教學中使用的主要教材或教學科研參考書籍。
近年來，本系教師承擔了數十項各類科研項目，包括國際合作項目、國家自然科學基金重大國際合作項目或面上項目、國家社會科學基金一般項目、國家重大專項項目、科技部科技支撐計劃專項，以及教育部、工信部、北京市等30多項研究課題；近3年來，本系教師承擔科研經費已超過1000萬元。充足的研究經費為本系教師的科研提供的保障。截止目前為止，本系教師分別在在國際著名學術期刊Science，Nature Biotechnology，Journal of Development Economics, Economic Development and Cultural Change, Energy Economics，Energy Policy，Research Policy, Applied Energy，求實等國內外重要學術期刊發表論文400余篇，其中SCI/SSCI論文100余篇，EI論文20余篇，CSSCI論文100余篇，他引次數總計超過600次。其中僅胡瑞法教授及其合作者發表的論文被SCI雜志他引便超過460余次。
